Дисципліна: Бази даних у біології

Обсяг дисципліни: 90 годин (3 кредити ЄКТС).

Мета дисципліни: формування базових знань про принципи та методи пошуку та обробки масивів біологічної інформації, набуття навичок роботи з біологічними базами даних.

Оволодіння навичками користування інтернет-ресурсами в галузі біології відкриває широкі можливості у використанні біоінформатики не лише для пошуку й аналізу вже існуючої інформації, але й для отримання нових знань із меншими затратами фізичних, матеріальних та часових ресурсів.

Засвоєння теоретичного курсу є основою для написання випускної кваліфікаційної роботи.

В результаті вивчення дисципліни студент повинен

знати:

-       принципи організації біологічних баз даних;

-       способи ефективного використання існуючих баз даних в окремих предметних галузях біології;

-       ефективне використання баз даних;

-       принципи функціонального керування біологічними базами даних;

-       принципи комп’ютерної обробки біологічної інформації;

-       основні статистичні методи аналізу біологічних даних.

вміти:

-       виконувати пошук релевантної інформації біологічного спрямування;

-       ефективно користуватися інформаційними базами даних у будь-якій галузі, зокрема й у біологічній;

-       створювати максимально ефективні запити для обробки інформації;

-       здійснювати аналіз отриманої інформації;

-       обирати методи статистичної обробки даних із використанням комп’ютерної техніки;

-       створювати узагальнені звіти для візуалізації інформації.

володіти навичками:

- самостійного пошуку необхідної інформації, використовуючи бібліографічні бази даних та релевантні джерела інформації мережі Інтернет;

- застосування методів аналізу інформації біологічного спрямування;

- застосування методів моделювання та структурування інформації;

- застосування сучасних методів обробки біологічної інформації.

Зміст дисципліни (тематика):

Тема 1. Типи баз даних.

Тема 2. Бібліографічні бази даних біологічної інформації.

Тема 3. Банки даних у ботаніці та їхні особливості.

Тема 4. Банки даних у зоології та їхні особливості.

Тема 5. Банки даних нуклеотидних та поліпептидних послідовностей.

Тема 6. Банки даних протеїнових структур.

Тема 7. Банки даних генетичної інформації.

Тема 8. Мікробіологічні та вірусологічні бази даних.

Тема 9. Похідні бази даних.

Тема 10. Пошукові системи.

Тема 11. Методи та програми статистичної обробки біологічної інформації.

Тема 12. Основи проєктування баз даних.

Види робіт: лекції, семінарські заняття, самостійна робота, контрольні роботи.